Что происходило с Элоизой в это время, остается неясным. Некоторые историки полагают, что Абеляр, возможно, уже устал от нее и убедил ее принять полный постриг, что означало, что он, в действительности, развелся с нею; и именно это вызвало гнев у Фульбера и стало причиной варварской мести за «честь племянницы». Другая версия гласит, что только после того, как преступление было совершено Абеляр, убедил Элоизу стать монахиней, на сей раз, она послушалась его и осталась жить в Аржантей.

Жизнь, свободная от сексуального искушения, была идеальной для монаха, и сам Абеляр ушел в монастырь, Аббатство Сен-Дени, вскоре после выздоровления. Там он написал трактат о Святой Троице, который был осужден как еретический церковными властями, и это привело к уходу Абеляра из Сен-Дени. Приблизительно в 1122 году он основал свое собственное религиозное сообщество, которое он назвал Параклетом. Несколько лет спустя он был избран аббатом Аббатства Сен-Жильдас в Бретани в 1125 году, и принял меры, чтобы Элоиза переселилась  в Параклет, поскольку он узнал, что она и некоторые другие женщин были выселены из монастыря Аржантей. К тому времени Элоиза стала приортессой или заместительницей аббатисы. Элоиза и Абеляр никогда не жили вместе снова, и не имели никакого контакта в течение почти двенадцати лет. Только, когда Элоиза узнала, что Абеляр написал трактат об их истории, Historia Calamitatum (История моих Неудач), она послала ему письмо. В последующих письмах она выражала свою все еще горячую преданность ему, и признавалась, что часы молитвы, ее религиозная жизнь часто разрушалась мыслями о чувственных удовольствиях, которые когда-то они разделяли. Они переписывались еще несколько лет, до смерти Абеляра в 1142 году. Элоиза оставалась аббатисой Параклета до своей смерти 19 мая 1163 года. Согласно легенде, Элоиза и Абеляр нашли свой совместный покой после смерти, и были похоронены вместе в Nogent-sur-Seine, но их останки были перемещены во время Революции. На известном парижском кладбище Пер-Лашез есть памятник, но неизвестно, покоится ли там прах их обоих, или только Абеляра. Их сын, Астраляб, также посвятил себя религии, он служил аббатом монастыря в том, что позже стало Швейцарией..